เทศบาลตำบลพะโต๊ะได้ยกฐานะจากสุขาภิบาลเมื่อวันที่ 25 พฤษภาคม 2542 ตามพระราชบัญญัติ การเปลี่ยนแปลงฐานะสุขาภิบาลเป็นเทศบาลทั่วประเทศ พ.ศ. 2542 ซึ่งเป็นหน่วยงานบริหารราชการส่วนท้องถิ่น ประกอบด้วยหมู่บ้านของเทศบาลตำบลพะโต๊ะ จำนวน 6 หมู่บ้าน เนื้อที่ประมาณ 6.66 ตารางกิโลเมตร อยู่ทางทิศตะวันตกเฉียงใต้ของจังหวัดชุมพร ห่างจากตัวจังหวัดชุมพรประมาณ 120 กิโลเมตร บริหารในรูปแบบสมาชิกสภาเทศบาล 12 คน สมาชิกมาจากการเลือกตั้งโดยตรงจากประชาชนในเขตเทศบาล คณะผู้บริหารประกอบด้วยนายกเทศมนตรี 1 คน มาจากการเลือกตั้ง รองนายกเทศมนตรี 2 คน ที่ปรึกษานายกเทศมนตรี 1 คน เลขานุการนายกเทศมนตรี 1 คน มาจากการแต่งตั้ง